全基因组重测序是指对已有参考基因组序列的物种进行个体或群体的全基因组测序，可以获得基因组上单核苷酸多态性位点（SNP, Single Nucleotide Polymorphism）、插入缺失（InDel,  Insertion/De-letion）及结构变异（SＶ, Structure Variation）、拷贝数变异（CNV, Copy Number Variations）和转座子变异等遗传特征，为遗传学研究和分子育种提供多态性标记信息，为物种进化、驯化过程以及功能基因组学的研究提供海量数据。

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