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代谢组学常见问题解答分享

添加时间:2021-12-10

   血浆和血清样本,哪一种做代谢组学比较好?

血浆和血清两种样本类型,均常出现在代谢组相关的研究中。两者从检测效果上来讲,差异不大,但是不同样本的基质效应是不一样的,不具备可比性,因此同一项目需要保证都是同样的样本类型。


    保存好几年的样本,能用来做代谢组吗?

样本质量直接影响代谢组结果。若样本是按照标准、统一的操作规范进行收集的,且收集好后及时冻存,保存期间未发生冻融, 这种情况下已经保存几年或十几年的,也是可以做代谢组的。


        非靶代谢 plus 与非靶代谢有何差异?

   非靶代谢 plus 的检测数量比 1.0 提高 2~4 倍。虽然非靶代谢 plus 是建立在非靶代谢的基础上,但是实验条件、参数和方法都进 行了系统的升级和优化,专门针对这套检测体系建立了 3 万 + 标准品二级谱图数据库,定性标准更严格,所以非靶代谢 plus 和 非靶代谢是两款不同的产品。


      为什么代谢物鉴定都强调是比对标准品谱图的定性结果呢

 (1) 由于许多代谢物的分子质量非常相近,并存在多种同分异构体(结构不同,但质量完全一样),因此仅依靠一级分子质量的匹 配只能获得大量的候选代谢物。举例如下:

代谢组学常见问题解答分享(图1)


(2) 二级谱图与代谢物本身的结构以及实验条件有关,特征性更强。例如上述例子中虽然 L-Homoserine 和 L-Allothreonine 具 有相同的分子质量,但二级谱图确存在显著差异。

代谢组学常见问题解答分享(图2)

    所以为获得准确可靠的定性结果,在一级匹配之后,首先进行同位素过滤以及保留时间校正,然后再将实测二级谱图与该检测 体系对应的标准品二级谱图进行匹配。匹配得分越高,表明该代谢物的可能性越大,从而在大量候选中进一步锁定了最有可能的代谢物。

(3) 考虑到一些情况下,即使比对标准品图谱,仍然会匹配到多个同分异构体,因此我们拥有丰富经验的技术人员会再根据代谢 物的性质,做进一步人工判别和确认。为保证代谢物的精确鉴定,我们不仅有与实验体系配套的标准品数据库用于结果匹配,还对定性结果进行人工二次确认,从而保证结果的可靠、准确。

 南京中科世康生物技术有限公司实验人员拥有十年的实战经验跟多个高校、医院老师合作,除蛋白组学外,还有膜片钳,还有代谢组学免疫组化,透射电镜、免疫电镜、HE染色,瑞氏染色、甲苯胺蓝染色、Masson染色、吉姆萨染色等等,期待您的咨询~   联系电话:4009688170


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